Viernes, 1 de agosto de 2014
Escherichia coli

Autor: Souza,Valeria

Escherichia coli es el organismo mejor conocido en términos de su genética y fisiología. Sin embargo, se sabe poco de su ecología y biología evolutiva. En este trabajo revisamos aspectos de su biología, genómica, ecología y genética de poblaciones. Estudios clásicos, basados principalmente en cepas aisladas de humanos, sugerían que E. coli es una especie con una fuerte estructura clonal, con poca o ninguna recombinación. Nosotros hemos ensamblado y analizado una colección llamada IECOL, con más de 2000 cepas provenientes de animales de varios lugares del mundo, de humanos de México y de cepas silvestres de diferentes ambientes. En este trabajo se presentan datos sobre genética de poblaciones y evolución molecular de E. coli obtenidos a partir de esta colección. Estos, junto con otros datos de la literatura reciente, indican que E. coli es un organismo muy diverso, con un genoma extraordinariamente dinámico donde la recombinación es importante, y que las combinaciones exitosas pueden dispersarse de manera epidémica en las poblaciones humanas o animales, dando una falsa señal de clonalidad. Finalmente, se ilustra el potencial de uso de la colección (IECOL) en estudios que estamos realizando sobre la evolución de tasas de mutación, y sobre la evolución de genes patogénicos en la especie.

Autor: Margall,Núria

Se describen los grupos de Escherichia coli enteropatógena, con especial atención a EC. enterohemorrágica. Algunos serotipos de E. Coli verotoxigénica son capaces de producir enteritis hemorrágica, que puede complicarse con el síndrome hemolítico urémico. Esta complicación, se da en particular en los niños y presenta una elevada letalidad. La transmisión a través de los alimentos y la capacidad de producir brotes epidémicos junto a la gravedad de las complicaciones de las enteritis confieren a este microorganismo una gran importancia en salud pública. Se revisa la epidemiología del microorganismo en nuestro país.

Autor: Blaauwen, Tanneke den

For growth and division of rod-shaped bacteria, the cylindrical part of the sacculus has to be elongated and two new cell poles have to be synthesized. The elongation is performed by a protein complex, the elongase that inserts disaccharidepentapeptide units at a limited number of discrete sites while using the cytoskeletal MreB helix as a tracking device. Upon initiation of cell division by positioning of the cytoskeletal Z-ring at mid cell, a switch from dispersed to concentrated local peptidoglycan-synthesis occurs. From this point on, peptidoglycan synthesis is for a large part redirected from elongating activity to synthesis of new cell poles by the divisome. The divisome might be envisioned as an extended elongase because apart from its basic peptidoglycan synthesizing activity, specific functions have to be added. These are conversion from a cylinder to a sphere, invagination of the outer membrane and addition of hydrolases that allow separation of the daughter cells. The elongase and the divisome are dynamic hyperstructures that probably share part of their proteins. Although this multifunctionality and flexibility form a barrier to the functional elucidation of its individual subunits, it helps the cells to survive a variety of emergency situations and to proliferate securely.

Autor: Gutiérrez A,Jenniffer J

Escherichia coli enterotoxigénica termolábil (ECET-TL) ha ocasionado un aumento en la morbilidad y mortalidad en humanos, siendo los métodos de diagnóstico existentes, complejos y costosos. El propósito de este estudio fue realizar evaluaciones inmunoquímicas sencillas con diferentes inmunosueros, preparados con fracciones de la cepa ECET-TL 1022 y confrontados con cepas de E. coli enterotoxigénicas y no Enterotoxigénicas de diferentes orígenes, para determinar la capacidad de los sueros de detectar la toxina (TL). La Inmunodifusión Radial resultó ser la técnica más apropiada bajo las condiciones de este trabajo. La Contrainmunoelectroforesis dio buenos resultados al introducir la modificación de permitir la difusión por 18 horas posterior a la electroforesis. El suero anti-periplásmico (II) demostró ser muy reactivo y específico, mientras que el suero anti-SDS-EDTA-ß-Mercaptoetanol (IV) fue específico pero poco reactivo.

Autor: Sánchez,Samanta

: En el presente estudio se realizó la caracterización de Escherichia coli Enteropatogénica (EPEC) y Escherichia coli Enterohemorrágica (EHEC), dos categorías patogénicas de E. coli, causantes de la lesión de adherencia y esfacelación (EAEE), en muestras de heces diarreicas de niños menores a 5 años. Método: El perfil patogénico de EAEE se realizó mediante el análisis por PCR, de los genes intimina (eae), bundlina (bfpA) y toxinas siga (stx1 y stx2). Estas pruebas, se complementaron con ensayos fenotípicos de la resistencia a antibióticos, fermentación de sorbitol y producción de ?-D-glucoronidasa. Resultados: La prevalencia de EAEE fue del 7% con preponderancia de las cepas EPEC (95%) sobre EHEC. Se encontró una mayor proporción (83%) de cepas EPEC atípicas que típicas. Un alto porcentaje de los aislados de EPEC es resistente a más de 5 antibióticos analizados. La frecuencia de multiresistencia a bloques de 5 y 2 antibióticos sugiere que la resistencia es transmisible por vía horizontal. La correlación entre la pertenencia a un serogrupo particular de EPEC y las características genotípicas, mostró heterogeneidad en el perfil de patogenicidad tanto entre un mismo como entre diferentes serogrupos, demostrando que el diagnóstico de DEC mediante serotipificación no es útil en nuestro medio. Los aislados de EHEC, se caracterizan por presentar una marcada susceptibilidad a los antibióticos. Se reporta la presencia de los serogrupos O157 y O6. Conclusiones: Este estudio, constituye el primer reporte en nuestro medio sobre la determinación y caracterización geno-fenotípica de EPEC y EHEC por métodos moleculares. En conjunto, los datos obtenidos tienen relevancia para el diagnóstico, tratamiento y estudio de la epidemiología de AEEC en las EDA en Bolivia

Autor: Gonzales Camarena,David Enmanuele

Describir la sensibilidad antibiótica de gérmenes prevalentes causantes de infecciones del tracto urinario en el Hospital Nacional Cayetano Heredia en el primer semestre del 2008. Material y métodos: Se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo de serie de casos. Se analizó los urocultivos positivos realizados en los meses de enero a junio del año 2008. Resultados: De 1249 urocultivos positivos, se aisló en pacientes no hospitalizados; Escherichia coli 76% seguido de Klebsiella spp. 5% y Citrobacter sp. 3%. Encontrando Escherichia coli sensible a amikacina, nitrofurantoína, ceftriaxona y ciprofloxacino y en 93,4%, 88,6%, 78% y 44,5% respectivamente. En pacientes hospitalizados la prevalencia fue; Escherichia coli 49% seguido de Enterococcus spp. 11,39% y Klebsiella spp. 8,42%. Encontrando Escherichia coli sensible a amikacina, nitrofurantoína, ceftriaxona y ciprofloxacino en 88,89%, 75,26%, 43,88% y 26,04%, respectivamente. Nitrofurantoína obtuvo resistencias bajas en hospitalizados 16,49% y en no hospitalizados 6.48% para Escherichia coli. Conclusiones: Se observó que amikacina vuelve a ser una buena opción como tratamiento empírico; así mismo hubo aumento en la resistencia a antibióticos comúnmente usados, sin embargo antibióticos poco usados como nitrofurantoína tienen mayores niveles de sensibilidad para Escherichia coli. (Rev Med Hered 2009;20:11-15).

Autor: Zambrano O,Pedro

Background: Hemolytic-uremic syndrome (HUS) is characterized by acute renal failure, microangiopathic hemolytic anemia and thrombocytopenia. Aim: To describe the characteñstics ofpatients with the diagnosis ofHUS in Chile, and to identify the most reliable early predictors oímorbidity and moñality. Material and methods: The clinical records ofpatients with HUS aged less than 15 years, attended between January 1990 and December 2003 in 15 hospitals, were reviewed. Demographic, clinical, biochemical, hematological parameters, morbidity and mortality were analyzed. Results: A cohort of 587 patients aged 2 to 8 years, 48% males, was analyzed. Ninety two percent had diarrhea. At the moment of diagnosis, anuria was observed in 39% of the patients, hypertension in 45% and seizures in 17%. Forty two percent required renal replacement therapy (RRT) and perítoneal dialysis was used in the majoríty of cases (78%). The most frequently isolated etiological agentwas Escherichia coli. Mortality rate was 2.9% in the acute phase of the disease and there was a positive correlation between mortality and anuria, seizures, white blood cell count (WCC) >20.000/mm³ and requirements of renal replacement therapy (p <0.05). Twelve percent of patients evolved to chronic renal failure and the risk factors during the acute phase were the need for renal replacement therapy, anuria, WCC >20.000/mm³, seizures and hypertension. Conclusions: The present study emphasizes important clinical and epidemiological aspeets ofHUSin a Chilean pediatricpopulation.

Autor: Díaz,Mauricio

Novel doublet molecules of cecropin A from Drosophila melanogaster were designed and constructed combining the regular (CECdir) with the inverted (CECret) coding sequence of the standard CEC A1 gene resulting in the following configurations: CECdir-CECret and CECret-CECdir. These two recombinant molecules were generated using a three-primer driven PCR reaction yielding composite single functional aminoacidic molecules with the coding sequences of CECdir linked in frame with the coding sequence of CECret and vice versa. In order to obtain these constructions, a retropeptide DNA-coding sequence was chemically synthesized to match the expected polarity of the newly generated CECret sequence. Both doublet antimicrobial peptides (drAMPs) were cloned in the T7 promoter driven expression plasmid pET27b+ and expressed in E. coli BL21 without any fusion protein. Only the former recombinant peptide was expressed and purified from cell extracts and its specific activity against two different bacteria showed to be higher than those displayed by their monomer parental counterparts.

Autor: Tang, Mengjia

Damage-induced SOS mutagenesis requiring the UmuD′C proteins occurs as part of the cells’ global response to DNA damage. In vitro studies on the biochemical basis of SOS mutagenesis have been hampered by difficulties in obtaining biologically active UmuC protein, which, when overproduced, is insoluble in aqueous solution. We have circumvented this problem by purifying the UmuD′2C complex in soluble form and have used it to reconstitute an SOS lesion bypass system in vitro. Stimulated bypass of a site-directed model abasic lesion occurs in the presence of UmuD′2C, activated RecA protein (RecA*), β-sliding clamp, γ-clamp loading complex, single-stranded binding protein (SSB), and either DNA polymerases III or II. Synthesis in the presence of UmuD′2C is nonprocessive on damaged and undamaged DNA. No lesion bypass is observed when wild-type RecA is replaced with RecA1730, a mutant that is specifically defective for Umu-dependent mutagenesis. Perhaps the most noteworthy property of UmuD′2C resides in its ability to stimulate both nucleotide misincorporation and mismatch extension at aberrant and normal template sites. These observations provide a biochemical basis for the role of the Umu complex in SOS-targeted and SOS-untargeted mutagenesis.

Autor: Araya-Fonseca,Carlos

Justificación y objetivos: La producción de ß-lactamasas es uno de los principales mecanismos de resistencia a antibióticos utilizados por las bacterias Gram negativas. A partir de los años 80 se describe en Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae un nuevo tipo de estas enzimas, las ß - lactamasas de spectro ampliado (BLEA) que inactivan todos los antibióticos ß -lactámicos, con excepción de los carbapenémicos. Su diseminación global ha sido muy rápida, lo que ha creado problemas terapéuticos importantes. Este trabajo tiene como objetivos el análisis de la frecuencia de las infecciones producidas por estas bacterias en pacientes internados en el Hospital San Juan de Dios (HSJD), los factores de riesgo para su adquisición y el análisis molecular de las enzimas identificadas. Metodología: Se revisaron los archivos del laboratorio de bacteriología del HSJD de 2004 y 2005, con el fin de identificar cepas de K. pneumoniae y E. coli productoras de BLEA. La muestra control fue seleccionada al azar entre los cultivos negativos de E. coli y K. pneumoniae por BLEA obtenidos durante mismo período en las bacterias de interés. Solo se incluyeron los reportes positivos por muestra intrahospitalarias. Se analizaron los factores de riesgo para adquirir estas infecciones en pacientes internados entre marzo y julio de 2004. Para la identificación de las bacterias, la sensibilidad a diversos antibióticos, así como la producción de BLEA, se utilizó el equipo automatizado VITEK R BioMérieux. La comprobación de la producción de estas enzimas se efectuó por medio de la prueba de disco empleando cefotaxima, cefotaxima + clavulanato, ceftazidima y ceftazidima + clavulanato.La identificación de las secuencias de los tipos de ß -lactamasas SHV-5, CTX-M y TEM se efectuó por medio de la prueba de reacción en cadena de la polimerasa. Resultados: En 2004, en el 12% de los aislamientos de E. coli y el 16% de K. pneumoniae se demostró la producción de BLEA. En 2005, el 18% y el 40% de esas bacterias, respectivamente, fueron BLEA+. Se estudiaron 44 pacientes y 47 controles y los factores de riesgo para adquirir infecciones por estos gérmenes fueron la estancia intrahospitalaria (p<0.05); ingresos previos al hospital (p<0.05); presencia de Diabetes Mellitus (p<0.02) o insuficiencia renal crónica (p<0.02); empleo de sondas, catéteres (p<0.001), tubo endotraqueal (p<0.05), el uso de ciprofloxacina (p<0.01), el uso de mezclas de antibióticos (p<0.01). Se demostró alta resistencia a gentamicina (78%), ciprofloxacina (85%), sulfametoxazol-trimetoprim (91%), piperacilina-tazobactam (78%) y cefepime (100%) en las bacterias productoras de BLEA. Los tipos de ß -lactamasa identificados en aislamientos de E. coli fueron TEM un 94%, SHV-55 en un 76%, y CTX-M en un 3% y en K. pneumoniae TEM en el 100%, CTX-M en el 30% y SHV-5 0%. En algunas bacterias se logró demostrar más de un tipo de enzima. Conclusiones: En el HSJD, la presencia de bacterias productoras de BLEA es un fenómeno que ha ido aumentando en los últimos años. Estas manifiestan baja sensibilidad a gran cantidad de antibióticos, lo que dificulta su manejo. En este estudio, solo el imipenem fue activo en el 100% de los aislamientos. Es llamativo el hecho de que SHV-5, el tipo de enzima más frecuentemente identificada en otras regiones en K. neumoniae, no se detectó en este studio.

Autor: Windrantz,Pal

The presence of total and fecal coliforms, E. coli. Listeria sp and Salmonella sp. was evaluated in 65 samples of both commercial and homemade ice cream. 37,1% of homemade ice cream and 20% of commercial ice cream did not fulfill the international standard for total coliforms. At the same time 82,9% of home made samples and 56,7% of commercial ones presented fecal coliforms. E. coli was found in 51,4% of home made samples and 26,7% of commercial ones. Sixteen Listeria sp. isolates were obtained, 50% corresponded to Listeria monocytogenes and 50% to L. innocua. The overall presence of L. monocytogenes in ice cream samples was of 12,3% and it was isolated in all cases, from homemade ice cream samples. Salmonella was not isolated from the samples analyzed. Although the results obtained show an important improvement in the quality of ice cream, compared with a previous work done also in Costa Rica, further efforts shall be done, in order to offer safe products to consumers.

Autor: Perozo-Mena,Armindo

La producción de Betalactamasas de Espectro Extendido por cepas de E. coli y K. pneumoniae, es un grave problema de salud pública ya que causa la pérdida de la eficacia terapéutica a los antibióticos ß-lactámicos. En este trabajo se investigó la presencia de betalactamasas de espectro extendido en cepas de E. coli y K. pneumoniae aisladas de pacientes de las unidades de cuidados intensivos de un hospital universitario. Se estudiaron 41 cepas de E. coli y 59 de K. pneumoniae, aisladas de los cultivos bacteriológicos realizados en el Centro de Referencia Bacterológica del Sevicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo (SAHUM). Para la detección de betalactamasas de espectro extendido se utilizaron los métodos normalizados por el Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). El 39,02% de las cepas de E. coli y el 52,54% de las de K. pneumoniae fueron betalactamasas de espectro extendido positivas, en estas cepas se observó resistencia acompañante a quinolonas, aminoglicósidos, cloranfenicol, tetraciclina y trimetoprima/sulfametoxazol. El estudio epidemiológico mediante Electroforesis de Campo Pulsado, mostró una gran diversidad genética entre los aislamientos, esta policlonalidad indica que la diseminación dentro del ambiente hospitalario no se da por transmisión de una cepa entre pacientes, sino que se da por transferencia de plásmidos entre diferentes cepas producto de la alta presión selectiva ejercida por la mala utilización de cefalosporinas de tercera generación.

Autor: Delgado,Romel

Las intoxicaciones e infecciones por consumo de pescados y moluscos representan un problema de salud pública que puede conducir a la discapacitación o muerte de las personas afectadas. En el presente trabajo se realizó un análisis retrospectivo de 1990 a 1999, de las características clínicas y etiológicas de las enfermedades transmitidas por el consumo de pescados y moluscos, estudiadas en el Departamento de Higiene de los Alimentos de la Corporación de Salud de Nueva Esparta, el Instituto Nacional de Higiene "Rafael Rangel" y Fundación La Salle de Ciencias Naturales. De un total de 133 casos estudiados, el 74% se analizó hasta la identificación microbiológica o toxicológica del agente causal y el 70% hasta la caracterización sintomatológica. El 73% de los casos fueron debidos a histamina y toxina paralizante de molusco (TPM) y el resto a Staphylococcus aureus y Escherichia coli. La distribución de casos por edad varió según el agente etiológico: E. coli afectó a todas las edades (10 a < 70 años), S. aureus afectó en 77% a los <10 años, histamina intoxicó en un 63% a los grupos entre 20 y 40 años y TPM afectó en un 51% a las edades entre 30 y 50 años. Los síntomas causados fueron variables: S. aureus y E. coli produjeron trastornos gastrointestinales (GI) en el 100% de los casos. Las intoxicaciones por histamina produjeron trastornos (GI) en un 52%, cefalea en un 48%, mareo (45%) y fiebre (15%) de los casos. La TPM causó parálisis en 97%, hormigueo 85%, calambres 85%, escalofríos 76%, mareo en 53%, prurito 50%, trastornos (GI) 38%, sed 24%, somnolencia 12% y cefalea en un 6% de los casos. Las enfermedades transmitidas por alimentos marinos en Nueva Esparta producen trastornos fisiológicos y tóxicos importantes, sugiriéndose la adecuada difusión de esta información en los centros de salud para la detección y tratamiento de los casos.

Autor: OROZCO,ANDRÉS FELIPE

Se presenta el caso de un soldado de veinte años de edad que desarrolló un absceso cerebral por Escherichia coli, secundario a un episodio de diarrea de siete días de evolución. Además de mostrar el curso clínico de la enfermedad y su tratamiento, se discuten las etiologías de los abscesos cerebrales, resaltando la importancia del seguimiento de las enfermedades diarreicas por simples que estas parezcan.

Autor: Pérez-Escudero, Alfonso

Optimization theory has been used to analyze evolutionary adaptation. This theory has explained many features of biological systems, from the genetic code to animal behavior. However, these systems show important deviations from optimality. Typically, these deviations are large in some particular components of the system, whereas others seem to be almost optimal. Deviations from optimality may be due to many factors in evolution, including stochastic effects and finite time, that may not allow the system to reach the ideal optimum. However, we still expect the system to have a higher probability of reaching a state with a higher value of the proposed indirect measure of fitness. In systems of many components, this implies that the largest deviations are expected in those components with less impact on the indirect measure of fitness. Here, we show that this simple probabilistic rule explains deviations from optimality in two very different biological systems. In Caenorhabditis elegans, this rule successfully explains the experimental deviations of the position of neurons from the configuration of minimal wiring cost. In Escherichia coli, the probabilistic rule correctly obtains the structure of the experimental deviations of metabolic fluxes from the configuration that maximizes biomass production. This approach is proposed to explain or predict more data than optimization theory while using no extra parameters. Thus, it can also be used to find and refine hypotheses about which constraints have shaped biological structures in evolution.