Jueves, 24 de abril de 2014
Escherichia coli

Autor: Bretschneider, Gustavo

Las cepas de E. coli enterohemorrágica (EHEC) constituyen un subgrupo de las E. coli verotoxigénicas (VTEC) o E. coli productoras de toxinas Shiga (Stx) (STEC). Dentro de este grupo, E. coli O157:H7 es el serotipo productor de Stx más conocido. Las cepas de EHEC producen colitis hemorrágica y el síndrome urémico hemolítico en humanos. Al igual que las cepas enteropatogénicas de E. coli (EPEC), estas cepas median su patogénesis a través de lesiones de "adherencia y destrucción" (lesión A/E). El ganado bovino es el principal reservorio de E. coli O157:H7 y se lo asocia directamente a la mayoría de los brotes en humanos. En esta revisión se analizan los factores de virulencia involucrados en la patogénesis de las cepas EHEC, especialmente aquellos que participan en la colonización de la mucosa intestinal de los bovinos.

Autor: Janga, Sarath Chandra

In prokaryotes, regulation of gene expression is predominantly controlled at the level of transcription. Transcription in turn is mediated by a set of DNA-binding factors called Transcription Factors (TFs). In this study, we map the complete repertoire of ~ 300 TFs of the bacterial model, Escherichia coli, onto gene expression data for a number of non-redundant experimental conditions and show that TFs are generally expressed at a lower level than other gene classes. We also demonstrate that different conditions harbor varying number of active TFs, with an average of about 15% of the total repertoire, with certain stress and drug induced conditions exhibiting as high as one-third of the collection of TFs. Our results also show that activators are more frequently expressed than repressors, indicating that activation of promoters might be a more common phenomenon than repression in bacteria. Finally, to understand the association of TFs with different conditions and to elucidate their dynamic interplay with other TFs, we develop a network-based framework to identify TFs which act as markers, those which are responsible for condition-specific transcriptional rewiring. This approach allowed us to pinpoint several marker TFs as being central in various specialized conditions like drug-induction or growth condition variations, which we discuss in light of previously reported experimental findings. Further analysis showed that a majority of identified markers effectively control the expression of their regulons and in general transcriptional programs of most conditions can be effectively rewired by a very small number of TFs. It was also found that closeness is a key centrality measure which can aid in the successful identification of marker TFs in regulatory networks. Our results suggest the utility of the network-based approaches developed in this study to be applicable for understanding other interactomic datasets.

Autor: Allende, Ana

The influence of wash water quality on the microbial load and sensory quality of fresh-cut escarole was evaluated. Additionally, the degree of Escherichia coli cross-contamination between inoculated and uninoculated products after washing was also studied. Three types of wash water, i.e., potable water, diluted recirculated water, and recirculated water, containing different microbial counts and organic loads, were used. Results showed that microbial load (P ≥ 0.02) and sensory quality (P > 0.625) of the product were not influenced by the water quality after washing and storage. Cross-contamination between inoculated and uninoculated products was observed after washing, as there was significant transmission of E. coli cells from the product to the wash water (P < 0.001). When fresh-cut escarole was contaminated at a high inoculum level (5.1 log CFU/g), wash water quality influenced the level of cross-contamination, as the highest E. coli load (P < 0.001) was shown in uninoculated fresh-cut escarole washed with recirculated water. However, when fresh-cut escarole was contaminated at a low inoculum level (3.2 log CFU/g), the wash water quality did not influence the level of cross-contamination, as E. coli slightly increased, although not at a statistically significant level, after the uninoculated product was washed with recirculated water (P > 0.035). Therefore, the contamination level may impact the effectiveness of water quality to reduce pathogen concentrations. It was clearly observed that cross-contamination of fresh-cut escarole with E. coli occurs, thereby suggesting that small amounts of contamination could impact the overall product and indicating the necessity of using wash water sanitizers to eliminate pathogens.

Autor: Pérez-Escudero, Alfonso

Optimization theory has been used to analyze evolutionary adaptation. This theory has explained many features of biological systems, from the genetic code to animal behavior. However, these systems show important deviations from optimality. Typically, these deviations are large in some particular components of the system, whereas others seem to be almost optimal. Deviations from optimality may be due to many factors in evolution, including stochastic effects and finite time, that may not allow the system to reach the ideal optimum. However, we still expect the system to have a higher probability of reaching a state with a higher value of the proposed indirect measure of fitness. In systems of many components, this implies that the largest deviations are expected in those components with less impact on the indirect measure of fitness. Here, we show that this simple probabilistic rule explains deviations from optimality in two very different biological systems. In Caenorhabditis elegans, this rule successfully explains the experimental deviations of the position of neurons from the configuration of minimal wiring cost. In Escherichia coli, the probabilistic rule correctly obtains the structure of the experimental deviations of metabolic fluxes from the configuration that maximizes biomass production. This approach is proposed to explain or predict more data than optimization theory while using no extra parameters. Thus, it can also be used to find and refine hypotheses about which constraints have shaped biological structures in evolution.

Autor: Badagliacca, P

In a rabbit production facility, health monitoring for enteropathies was performed in 15 production cycles for 20 mo. For each cycle, up to a hundred 35 d old rabbits weaned the same day were randomly selected, reared in the same fattening unit, but separately from the source batch and fed with the same feed except for antimicrobial supplementation. Clinical symptoms and enteric lesions of the selected group were recorded, using two checklists with binomial response (yes/no answer to a list of 54 clinical and enteric variables). The day after weaning, one week later, at the beginning of the enteric symptoms and 4-5 d after the start of the symptoms, inocula from the small intestine and caecum of selected animals were subjected to microbiological, C. spiroforme, Eimeria oocyst and rotavirus antigen detection tests. Representative samples of E. coli and C. perfringens isolates were tested, respectively, for serotype, biotype, eae, afr/2 genes and for a, b1, b2, e, i and enterotoxin toxin genes. The answers to the clinical-pathological variables were subjected to statistical analysis with a cluster analysis programme in order to obtain homogeneous, statistically significant groups of diseased animals (clusters). Then, the clusters were statistically associated with the laboratory outcomes. The cluster to which the enterotyphlitis lesions significantly contributed was associated with E. coli detection, E. coli O103 serotype detection and C. spiroforme ("several elements" variable). C. spiroforme ("rare elements" variable) was significantly associated with a cluster, characterised by a pathological profile consisting of bloating/rumbling noise and liquid content in stomach and caecum, without enteric inflammation. C. perfringens was significantly associated with a cluster, characterised by a pathological profile consisting of dilation/liquid content of small intestine, caecal impaction and mucoid content in the colon. Eighteen out of twenty-fi ve C. perfringens strains, examined for their toxin genotypes, proved to be toxin type A, while 7 out of 25 strains showed the a and b2 toxin genes in combination. The rotavirus antigen and Eimeria oocysts were detected from healthy rabbits (specimens of the day after weaning and one week later) in about 15% of specimens examined, but their presence in the sick animals was not significantly associated with any cluster.

Autor: García López, José Luis

La presente invención consiste en la realización de un procedimiento para producir ácido 2-hidroxifenil-acético (2HPA) en Escherichia coli. La invención
reivindica el uso los marcos de lectura abiertos implicados en el catabolismo del ácido fenilacético (PA) y responsables de la transformación de éste en su derivado hidroxilado en posición 2. La síntesis de
2HPA a partir de PA se consigue bloqueando la ruta catabólica de PA o mediante la expresión de los marcos de lectura abiertos que codifican algunas de las etapas del catabolismo de PA. El procedimiento de
biotransformación se consigue tanto con células en crecimiento como con células en suspensión. El procedimiento es una alternativa, con muchas ventajas, al de la síntesis química de 2HPA.

Autor: Karczmarek, Aneta

The bacterial actin homologue MreB forms a helix underneath the cytoplasmic membrane and was shown to be essential in the morphogenesis of the rod-shaped cells. Additionally, MreB was implicated to be involved in DNA segregation. However, in our hands the mreBCD deletion strain (PA340-678) grew without apparent DNA segregation defect, suggesting that the reported chromosome segregation inhibition could be caused by a temporarily effect of MreB inhibition or depletion. To assess the involvement of
MreB in DNA segregation during the transition from rod to sphere, we compared the effect of A22 and the PBP2 inhibitor mecillinam on the percentage of cells with segregated nucleoids and the number of oriC foci in wild-type Escherichia coli cells. Cells became spherical in the same time window during both treatments and we could not detect any difference in the chromosome or oriC segregation between these two treatments. Additionally, flow cytometric analyses showed that A22 and mecillinam treatment gave
essentially the same chromosome segregation
pattern. We conclude that MreB is not directly involved in DNA segregation of E. coli.

Autor: Monge,Rafael

Se estudió la calidad nutricional y microbiológica de 80 muestras de embutidos de soya (50% mortadela y 50% salchicha). El promedio de proteína en la mortadela fue de 17,5g/100 g y en la salchicha 20g/100g. El contenido de grasa total fue de 5.5g/100g para ambos productos; no obstante, se hallaron diferencias altamente significativas (0.0000) en el contenido de los diferentes ácidos grasos entre ambos productos y en las muestras de un mismo producto dependiendo de la industria que los elaborara. Las mayores diferencias se evidenciaron en los niveles de ácido palmítico (C16:0), ácido oleico (C18:1) y ácido linoleico (C18:2). En ninguna muestra se evidenció la presencia de colesterol. El índice de aterogenicidad promedio para mortadela fue 0.55 y para salchicha 0.59. El consumo de 25 gramos de proteína de soya derivada de estos embutidos puede generar aportar entre el 20-90% de la cantidad de ácidos grasos saturados recomendada por día. Así mismo, puede brindar entre el 12-70% de la cantidad de ácidos graso s poliinsaturados recomendada por día. Estas variaciones responden a las importantes diferencias en la especiación de ácidos grasos evidenciadas según la marca del producto. El 20% de los embutidos estudiados mostraron niveles de coliformes totales> 10(4)/g, lo cual fue más frecuente en la salchicha. El 60% de las muestras de este embutido y el 10% de las muestras de mortadela mostraron niveles de psicrótrofos > 10(6)/g. En ninguna de las muestras se evidenció Escherichia coli y en el 5% Clostridium perfringens en niveles mayores a 10²/g. Los resultados señalan la urgente necesidad de implementar un sistema de control de calidad de los embutidos de soya, antes que las autoridades de salud consideren respaldar las campañas nutricionales que promuevan el consumo de los mismos.

Autor: González,Mayelys

La ostra Crassostrea rhizophorae es consumida comúnmente en diversas playas del estado Sucre, sin conocer la carga microbiana que éstas presentan. Por tal motivo se evaluó la calidad microbiológica de la misma y de muestras de agua proveniente de tres estaciones del banco natural de Laguna Grande del Obispo, con el propósito de verificar el cumplimiento de los requisitos microbiológicos establecidos por la Legislación Sanitaria Venezolana y la Administración de Alimentos y Drogas de los Estados Unidos (FDA). Se realizaron muestreos mensuales entre agosto 2005 y julio 2006, determinándose el NMP/100 mL de coliformes totales (CT) y coliformes fecales (CF) en muestras de agua, mientras que en los bivalvos se cuantificó el NMP de CT, CF y Escherichia coli (EC) por gramo de ostra, además de la detección de Salmonella spp. Los resultados obtenidos de CT y CF en muestras de agua de las tres estaciones, cumplieron en la mayoría de los meses, con las exigencias permitidas (70 NMP/100 mL de CT y 14 NMP/100 mL de CF). Durante los meses de muestreo y entre las estaciones analizadas, se observaron variaciones considerables en los valores de CF y EC que estuvieron entre 0 y 2,4 × 10(4) NMP/g de ostra. Los límites permitidos de CF y EC (230 NMP/g de ostra) fueron excedidos por los CF en todas las estaciones durante agosto y diciembre 2005, y también en marzo, mayo y junio 2006, mientras que los de EC se excedieron sólo en diciembre 2005, y marzo y mayo 2006. Salmonella spp. fue detectada en la primera y segunda estación para el mes de septiembre 2005, en la tercera estación para el mes de diciembre del mismo año y en la segunda y tercera estación, para los meses de mayo y julio 2006. Los resultados obtenidos reflejan un alto riesgo de consumir estos moluscos sin haber sido previamente sometidos a una depuración.

Autor: Ramos Martínez,A.

Los pacientes sometidos a sondaje vesical permanente presentan riesgo de padecer episodios de bacteriemias por Escherichia coli. Se presenta el caso de un varón de 88 años portador de sonda vesical permanente que ingresó por fractura cerrada subcapital del húmero izquierdo y hematuria debida a un carcinoma de vejiga. Durante el ingreso fue sometido a lavados vesicales y a una cistoscopia. Al octavo día de ingreso presentó un incremento de la tumefacción en el hombro izquierdo. Tanto la radiografía simple como la TAC demostraron aire en la proximidad de la fractura. Se intervino al paciente comprobando la existencia de un absceso maloliente sobre la fractura. Se aisló E. coli. La osteomielitis hematógena sobre un fractura cerrada es una complicación infrecuente que puede pasar desapercibida y se acompaña de un mal pronóstico. El uso racional y selectivo del sondaje vesical podría evitar algunos casos semejantes al presentado.

Autor: Morales,José-Luis

Objetivo: Estudiar la presencia de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) e identificar los tipos Temoniera (TEM) y sulfidrilo variable (SHV) producidas por cepas de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae en dos hospitales de Lima. Material y Métodos: La selección y confirmación de cepas productoras de BLEE se realizó mediante pruebas de susceptibilidad antimicrobiana, utilizando los criterios de la National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS); la identificación de los genes blaTEM y blaSHV se realizó mediante el análisis de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para su posterior secuenciamiento genético. Resultados: Se recolectó consecutivamente entre julio y septiembre de 2000, 137 cepas de Escherichia coli y 18 cepas de Klebsiella pneumoniae. La mayoría mostró alta resistencia a las cefalosporinas de tercera generación y aztreonam; 2,9% del total de E.coli y 44,4% del total de K.pneumoniae aisladas fueron confirmadas como productoras de BLEE. Todas las cepas productoras de BLEE fueron multirresistentes y la mayoría presentó co-resistencia a sulfametoxazol/trimetoprim, amikacina, gentamicina y ciprofoxacina. Se identificó la presencia del gen blaTEM en 4 cepas (3 K. pneumoniae y 1 E. coli) y el gen blaSHV en 6 cepas (3 K. pneumoniae y 3 E. coli). El secuenciamiento de los correspondientes genes confirmó las BLEEs TEM-10 y SHV-5. Conclusión: Se demostró la presencia de BLEE tipo TEM y SHV, asociado a multirresistencia antibiótica.

Autor: Sanz Carabaña,P.

Introducción: La bacteriemia adquirida en la comunidad es un problema frecuente y de elevada mortalidad. El índice de Pitt, calculado en base a la temperatura, el estado mental, y las funciones circulatoria y respiratoria del paciente es una herramienta útil para conocer el pronóstico de pacientes con bacteriemia. Los objetivos fueron conocer la etiología de las bacteriemias adquiridas en la comunidad en nuestro entorno, el porcentaje de pacientes con tratamiento empírico incorrecto, y determinar la mortalidad y los factores independientes asociados con el fallecimiento del paciente, incluido el índice de Pitt. Método: Estudio observacional de una cohorte de pacientes mayores de 18 años ingresados en un hospital terciario por una infección adquirida en la comunidad con bacteriemia. Veintiocho casos fueron desestimados por considerar el aislamiento bacteriano como contaminante. Resultados: Se incluyeron 75 enfermos con un promedio de edad de 68,6 ± 18,2 años, 38 mujeres (51%). La mortalidad fue del 23% (IC95% 13,8 - 33,8). Las bacterias más frecuentemente aisladas en los hemocultivos fueron Escherichia coli, Staphylococcus aureus, estafilococos coagulasa negativo, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus viridans, enterococos y Klebsiella spp. La mortalidad de los pacientes con un tratamiento antibiótico empírico inadecuado (18%, 3 pacientes) no fue inferior a los que recibieron un tratamiento empírico correcto en urgencias (24 %, 14 pacientes, p = 0,42). Los factores independientes pronósticos de mortalidad, fueron la baja concentración plasmática de albúmina, OR = 5,17 (IC 95% 1,45-16,7) para cada descenso de 1 g/dl, el elevado índice de Pitt OR = 1,50 (IC 95% 1,01-2,24) para cada aumento de una unidad, y la elevada gravedad de la enfermedad de base medida por el índice de McCabe y Jackson OR = 5,08 ( IC 95% 1,43-16,7). Conclusiones: El tratamiento antibiótico empírico incorrecto no influyó en la mortalidad de pacientes con bacteriemia comunitaria. Los factores pronósticos de mortalidad fueron la concentración plasmática de albúmina, el índice de Pitt y la gravedad de la enfermedad de base medida por el índice de McCabe y Jackson.

Autor: Sánchez,Samanta

: En el presente estudio se realizó la caracterización de Escherichia coli Enteropatogénica (EPEC) y Escherichia coli Enterohemorrágica (EHEC), dos categorías patogénicas de E. coli, causantes de la lesión de adherencia y esfacelación (EAEE), en muestras de heces diarreicas de niños menores a 5 años. Método: El perfil patogénico de EAEE se realizó mediante el análisis por PCR, de los genes intimina (eae), bundlina (bfpA) y toxinas siga (stx1 y stx2). Estas pruebas, se complementaron con ensayos fenotípicos de la resistencia a antibióticos, fermentación de sorbitol y producción de ?-D-glucoronidasa. Resultados: La prevalencia de EAEE fue del 7% con preponderancia de las cepas EPEC (95%) sobre EHEC. Se encontró una mayor proporción (83%) de cepas EPEC atípicas que típicas. Un alto porcentaje de los aislados de EPEC es resistente a más de 5 antibióticos analizados. La frecuencia de multiresistencia a bloques de 5 y 2 antibióticos sugiere que la resistencia es transmisible por vía horizontal. La correlación entre la pertenencia a un serogrupo particular de EPEC y las características genotípicas, mostró heterogeneidad en el perfil de patogenicidad tanto entre un mismo como entre diferentes serogrupos, demostrando que el diagnóstico de DEC mediante serotipificación no es útil en nuestro medio. Los aislados de EHEC, se caracterizan por presentar una marcada susceptibilidad a los antibióticos. Se reporta la presencia de los serogrupos O157 y O6. Conclusiones: Este estudio, constituye el primer reporte en nuestro medio sobre la determinación y caracterización geno-fenotípica de EPEC y EHEC por métodos moleculares. En conjunto, los datos obtenidos tienen relevancia para el diagnóstico, tratamiento y estudio de la epidemiología de AEEC en las EDA en Bolivia

Autor: Sánchez,Samanta

: En el presente estudio se realizó la caracterización de Escherichia coli Enteropatogénica (EPEC) y Escherichia coli Enterohemorrágica (EHEC), dos categorías patogénicas de E. coli, causantes de la lesión de adherencia y esfacelación (EAEE), en muestras de heces diarreicas de niños menores a 5 años. Método: El perfil patogénico de EAEE se realizó mediante el análisis por PCR, de los genes intimina (eae), bundlina (bfpA) y toxinas siga (stx1 y stx2). Estas pruebas, se complementaron con ensayos fenotípicos de la resistencia a antibióticos, fermentación de sorbitol y producción de ?-D-glucoronidasa. Resultados: La prevalencia de EAEE fue del 7% con preponderancia de las cepas EPEC (95%) sobre EHEC. Se encontró una mayor proporción (83%) de cepas EPEC atípicas que típicas. Un alto porcentaje de los aislados de EPEC es resistente a más de 5 antibióticos analizados. La frecuencia de multiresistencia a bloques de 5 y 2 antibióticos sugiere que la resistencia es transmisible por vía horizontal. La correlación entre la pertenencia a un serogrupo particular de EPEC y las características genotípicas, mostró heterogeneidad en el perfil de patogenicidad tanto entre un mismo como entre diferentes serogrupos, demostrando que el diagnóstico de DEC mediante serotipificación no es útil en nuestro medio. Los aislados de EHEC, se caracterizan por presentar una marcada susceptibilidad a los antibióticos. Se reporta la presencia de los serogrupos O157 y O6. Conclusiones: Este estudio, constituye el primer reporte en nuestro medio sobre la determinación y caracterización geno-fenotípica de EPEC y EHEC por métodos moleculares. En conjunto, los datos obtenidos tienen relevancia para el diagnóstico, tratamiento y estudio de la epidemiología de AEEC en las EDA en Bolivia

Autor: Díaz,Mauricio

Novel doublet molecules of cecropin A from Drosophila melanogaster were designed and constructed combining the regular (CECdir) with the inverted (CECret) coding sequence of the standard CEC A1 gene resulting in the following configurations: CECdir-CECret and CECret-CECdir. These two recombinant molecules were generated using a three-primer driven PCR reaction yielding composite single functional aminoacidic molecules with the coding sequences of CECdir linked in frame with the coding sequence of CECret and vice versa. In order to obtain these constructions, a retropeptide DNA-coding sequence was chemically synthesized to match the expected polarity of the newly generated CECret sequence. Both doublet antimicrobial peptides (drAMPs) were cloned in the T7 promoter driven expression plasmid pET27b+ and expressed in E. coli BL21 without any fusion protein. Only the former recombinant peptide was expressed and purified from cell extracts and its specific activity against two different bacteria showed to be higher than those displayed by their monomer parental counterparts.