Viernes, 6 de marzo de 2015
Escherichia coli

Autor: Aguilera,Greana

La miel de abeja es un fluido dulce y viscoso producido por las abejas a partir del néctar y de la mielada. Se trata de una medicina antigua utilizada principalmente en el tratamiento de heridas, úlceras y quemaduras. En el presente trabajo se evaluó la actividad antimicrobiana de nueve mieles venezolanas, para lo cual se utilizaron cepas ATCC de Escherichia coli y Staphylococcus aureus. Las mieles analizadas se utilizaron concentradas y diluidas (1:2, 1:4, 1:8). Se observó la inhibición del crecimiento de S. aureus en la miel procedente del estado Trujillo sin diluir y en su dilución 1:2, mientras que no se observó inhibición del crecimiento de las cepas de E. coli, por lo que deberían probarse otras bacterias para futuras aplicaciones.

Autor: Araya-Fonseca,Carlos

Justificación y objetivos: La producción de ß-lactamasas es uno de los principales mecanismos de resistencia a antibióticos utilizados por las bacterias Gram negativas. A partir de los años 80 se describe en Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae un nuevo tipo de estas enzimas, las ß - lactamasas de spectro ampliado (BLEA) que inactivan todos los antibióticos ß -lactámicos, con excepción de los carbapenémicos. Su diseminación global ha sido muy rápida, lo que ha creado problemas terapéuticos importantes. Este trabajo tiene como objetivos el análisis de la frecuencia de las infecciones producidas por estas bacterias en pacientes internados en el Hospital San Juan de Dios (HSJD), los factores de riesgo para su adquisición y el análisis molecular de las enzimas identificadas. Metodología: Se revisaron los archivos del laboratorio de bacteriología del HSJD de 2004 y 2005, con el fin de identificar cepas de K. pneumoniae y E. coli productoras de BLEA. La muestra control fue seleccionada al azar entre los cultivos negativos de E. coli y K. pneumoniae por BLEA obtenidos durante mismo período en las bacterias de interés. Solo se incluyeron los reportes positivos por muestra intrahospitalarias. Se analizaron los factores de riesgo para adquirir estas infecciones en pacientes internados entre marzo y julio de 2004. Para la identificación de las bacterias, la sensibilidad a diversos antibióticos, así como la producción de BLEA, se utilizó el equipo automatizado VITEK R BioMérieux. La comprobación de la producción de estas enzimas se efectuó por medio de la prueba de disco empleando cefotaxima, cefotaxima + clavulanato, ceftazidima y ceftazidima + clavulanato.La identificación de las secuencias de los tipos de ß -lactamasas SHV-5, CTX-M y TEM se efectuó por medio de la prueba de reacción en cadena de la polimerasa. Resultados: En 2004, en el 12% de los aislamientos de E. coli y el 16% de K. pneumoniae se demostró la producción de BLEA. En 2005, el 18% y el 40% de esas bacterias, respectivamente, fueron BLEA+. Se estudiaron 44 pacientes y 47 controles y los factores de riesgo para adquirir infecciones por estos gérmenes fueron la estancia intrahospitalaria (p<0.05); ingresos previos al hospital (p<0.05); presencia de Diabetes Mellitus (p<0.02) o insuficiencia renal crónica (p<0.02); empleo de sondas, catéteres (p<0.001), tubo endotraqueal (p<0.05), el uso de ciprofloxacina (p<0.01), el uso de mezclas de antibióticos (p<0.01). Se demostró alta resistencia a gentamicina (78%), ciprofloxacina (85%), sulfametoxazol-trimetoprim (91%), piperacilina-tazobactam (78%) y cefepime (100%) en las bacterias productoras de BLEA. Los tipos de ß -lactamasa identificados en aislamientos de E. coli fueron TEM un 94%, SHV-55 en un 76%, y CTX-M en un 3% y en K. pneumoniae TEM en el 100%, CTX-M en el 30% y SHV-5 0%. En algunas bacterias se logró demostrar más de un tipo de enzima. Conclusiones: En el HSJD, la presencia de bacterias productoras de BLEA es un fenómeno que ha ido aumentando en los últimos años. Estas manifiestan baja sensibilidad a gran cantidad de antibióticos, lo que dificulta su manejo. En este estudio, solo el imipenem fue activo en el 100% de los aislamientos. Es llamativo el hecho de que SHV-5, el tipo de enzima más frecuentemente identificada en otras regiones en K. neumoniae, no se detectó en este studio.

Autor: Díaz,Mauricio

Novel doublet molecules of cecropin A from Drosophila melanogaster were designed and constructed combining the regular (CECdir) with the inverted (CECret) coding sequence of the standard CEC A1 gene resulting in the following configurations: CECdir-CECret and CECret-CECdir. These two recombinant molecules were generated using a three-primer driven PCR reaction yielding composite single functional aminoacidic molecules with the coding sequences of CECdir linked in frame with the coding sequence of CECret and vice versa. In order to obtain these constructions, a retropeptide DNA-coding sequence was chemically synthesized to match the expected polarity of the newly generated CECret sequence. Both doublet antimicrobial peptides (drAMPs) were cloned in the T7 promoter driven expression plasmid pET27b+ and expressed in E. coli BL21 without any fusion protein. Only the former recombinant peptide was expressed and purified from cell extracts and its specific activity against two different bacteria showed to be higher than those displayed by their monomer parental counterparts.

Autor: Janga, Sarath Chandra

In prokaryotes, regulation of gene expression is predominantly controlled at the level of transcription. Transcription in turn is mediated by a set of DNA-binding factors called Transcription Factors (TFs). In this study, we map the complete repertoire of ~ 300 TFs of the bacterial model, Escherichia coli, onto gene expression data for a number of non-redundant experimental conditions and show that TFs are generally expressed at a lower level than other gene classes. We also demonstrate that different conditions harbor varying number of active TFs, with an average of about 15% of the total repertoire, with certain stress and drug induced conditions exhibiting as high as one-third of the collection of TFs. Our results also show that activators are more frequently expressed than repressors, indicating that activation of promoters might be a more common phenomenon than repression in bacteria. Finally, to understand the association of TFs with different conditions and to elucidate their dynamic interplay with other TFs, we develop a network-based framework to identify TFs which act as markers, those which are responsible for condition-specific transcriptional rewiring. This approach allowed us to pinpoint several marker TFs as being central in various specialized conditions like drug-induction or growth condition variations, which we discuss in light of previously reported experimental findings. Further analysis showed that a majority of identified markers effectively control the expression of their regulons and in general transcriptional programs of most conditions can be effectively rewired by a very small number of TFs. It was also found that closeness is a key centrality measure which can aid in the successful identification of marker TFs in regulatory networks. Our results suggest the utility of the network-based approaches developed in this study to be applicable for understanding other interactomic datasets.

Autor: Sánchez,Liliana

Objetivo. Determinar la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y su prevalencia en aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae causa de infección hospitalaria en una clínica de Villavicencio. Metodología. Se analizaron 50 aislamientos, 29 de E. coli y 21 de K. pneumoniae provenientes de pacientes hospitalizados en una clínica de segundo nivel de la ciudad de Villavicencio; se emplearon los métodos de difusión de disco de CLSI y el método confirmatorio para la detección de las BLEE de MicroScan® ESBL. Resultados. De 50 aislamientos, 3 (6%) presentaban BLEE, 2 K. pneumoniae y 1 E. coli. Estos aislamientos también mostraron resistencia con las fluoroquinolonas y el trimetoprim-sulfametoxazol. Los métodos de difusión de disco de CLSI y MicroScan® ESBL fueron concordantes en los resultados para la confirmación de la producción de BLEE. Conclusiones. El estudio permitió demostrar la producción de BLEE en K. pneumoniae y E. coli en una clínica de Villavicencio. Aunque es baja la frecuencia de BLEE, se sugiere seguir el uso restringido de cefalosporinas de tercera generación y fortalecer los mecanismos de control de la infección.

Autor: COLORADO R.,Jhonny

La bioautografía es una técnica sencilla y rápida que combina las ventajas de la cromatografía en capa fina y la detección de actividad antimicrobiana, logrando visualizar directamente la(s) fracción(es) con actividad antimicrobiana. Determinar la eficacia de esta técnica puede facilitar el panorama en el aislamiento de sustancias antimicrobianas presentes en mezclas complejas. El trabajo descrito es un avance para evaluar si la técnica permite cuantificar la actividad antimicrobiana empleando como referencia el aminoglicósido Gentamicina® y su actividad contra el microorganismo patógeno Escherichia coli (E.coli). La cuantificación de la actividad antimicrobiana se verifica al medir el diámetro del halo de difusión que se genera al aplicar soluciones de diferentes concentraciones de Gentamicina sobre placas cromatográficas; al determinar luego el efecto del volumen aplicado sobre la variabilidad de los resultados y finalmente al analizar las diferencias entre los halos de difusión y de inhibición microbiana. En el presente estudio se encuentra que la difusión del antibiótico sobre las placas es un factor determinante para cuantificar, y que existe un rango de concentraciones donde la fuerte interacción entre las variables aludidas permite predecir que se cuenta con un método validable para detectar y cuantificar la actividad antimicrobiana, sobre todo en mezclas complejas.

Autor: Gonzales Camarena,David Enmanuele

Describir la sensibilidad antibiótica de gérmenes prevalentes causantes de infecciones del tracto urinario en el Hospital Nacional Cayetano Heredia en el primer semestre del 2008. Material y métodos: Se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo de serie de casos. Se analizó los urocultivos positivos realizados en los meses de enero a junio del año 2008. Resultados: De 1249 urocultivos positivos, se aisló en pacientes no hospitalizados; Escherichia coli 76% seguido de Klebsiella spp. 5% y Citrobacter sp. 3%. Encontrando Escherichia coli sensible a amikacina, nitrofurantoína, ceftriaxona y ciprofloxacino y en 93,4%, 88,6%, 78% y 44,5% respectivamente. En pacientes hospitalizados la prevalencia fue; Escherichia coli 49% seguido de Enterococcus spp. 11,39% y Klebsiella spp. 8,42%. Encontrando Escherichia coli sensible a amikacina, nitrofurantoína, ceftriaxona y ciprofloxacino en 88,89%, 75,26%, 43,88% y 26,04%, respectivamente. Nitrofurantoína obtuvo resistencias bajas en hospitalizados 16,49% y en no hospitalizados 6.48% para Escherichia coli. Conclusiones: Se observó que amikacina vuelve a ser una buena opción como tratamiento empírico; así mismo hubo aumento en la resistencia a antibióticos comúnmente usados, sin embargo antibióticos poco usados como nitrofurantoína tienen mayores niveles de sensibilidad para Escherichia coli. (Rev Med Hered 2009;20:11-15).

Autor: Blaauwen, Tanneke den

For growth and division of rod-shaped bacteria, the cylindrical part of the sacculus has to be elongated and two new cell poles have to be synthesized. The elongation is performed by a protein complex, the elongase that inserts disaccharidepentapeptide units at a limited number of discrete sites while using the cytoskeletal MreB helix as a tracking device. Upon initiation of cell division by positioning of the cytoskeletal Z-ring at mid cell, a switch from dispersed to concentrated local peptidoglycan-synthesis occurs. From this point on, peptidoglycan synthesis is for a large part redirected from elongating activity to synthesis of new cell poles by the divisome. The divisome might be envisioned as an extended elongase because apart from its basic peptidoglycan synthesizing activity, specific functions have to be added. These are conversion from a cylinder to a sphere, invagination of the outer membrane and addition of hydrolases that allow separation of the daughter cells. The elongase and the divisome are dynamic hyperstructures that probably share part of their proteins. Although this multifunctionality and flexibility form a barrier to the functional elucidation of its individual subunits, it helps the cells to survive a variety of emergency situations and to proliferate securely.

Autor: Sánchez,Samanta

: En el presente estudio se realizó la caracterización de Escherichia coli Enteropatogénica (EPEC) y Escherichia coli Enterohemorrágica (EHEC), dos categorías patogénicas de E. coli, causantes de la lesión de adherencia y esfacelación (EAEE), en muestras de heces diarreicas de niños menores a 5 años. Método: El perfil patogénico de EAEE se realizó mediante el análisis por PCR, de los genes intimina (eae), bundlina (bfpA) y toxinas siga (stx1 y stx2). Estas pruebas, se complementaron con ensayos fenotípicos de la resistencia a antibióticos, fermentación de sorbitol y producción de ?-D-glucoronidasa. Resultados: La prevalencia de EAEE fue del 7% con preponderancia de las cepas EPEC (95%) sobre EHEC. Se encontró una mayor proporción (83%) de cepas EPEC atípicas que típicas. Un alto porcentaje de los aislados de EPEC es resistente a más de 5 antibióticos analizados. La frecuencia de multiresistencia a bloques de 5 y 2 antibióticos sugiere que la resistencia es transmisible por vía horizontal. La correlación entre la pertenencia a un serogrupo particular de EPEC y las características genotípicas, mostró heterogeneidad en el perfil de patogenicidad tanto entre un mismo como entre diferentes serogrupos, demostrando que el diagnóstico de DEC mediante serotipificación no es útil en nuestro medio. Los aislados de EHEC, se caracterizan por presentar una marcada susceptibilidad a los antibióticos. Se reporta la presencia de los serogrupos O157 y O6. Conclusiones: Este estudio, constituye el primer reporte en nuestro medio sobre la determinación y caracterización geno-fenotípica de EPEC y EHEC por métodos moleculares. En conjunto, los datos obtenidos tienen relevancia para el diagnóstico, tratamiento y estudio de la epidemiología de AEEC en las EDA en Bolivia

Autor: López,V

RESUMEN. Efecto de la radiación gamma en la calidad microbiológica de vegetales minimamente procesados. Se determinó la microflora inicial de apio y repollo minimamente procesado, envasado en atmósfera controlada, proveniente de un proveedor y disponible en una cadena de supermercados de la ciudad de Santiago de Chile. Aunque no se detectó E. coli ni presencia de Salmonella spp, los recuentos de aerobios mesófilos y de enterobacterias fueron elevados (≥ 105 ufc/g), sobrepasando en la mayoría de los casos las especificaciones de la legislación chilena. Se determinó el valor D10 para dos cepas de E. coli (ATCC 8739 y una cepa silvestre aislada de vegetales) inoculadas como microorganismos indicadores. Se estudió la variación de la población microbiana y la calidad sensorial, después de irradiar con dosis de 5 D10 (1 kGy), durante un período de almacenamiento de 7 días a 5ºC. En apio irradiado se observó una reducción de 4,7 y 3,8 ciclos logarítmicos en el recuento de aerobios mesófilos y de enterobacterias, respectivamente. En repollo la reducción fue de 3,8 y 3,6 logaritmos para recuento de aerobios mesófilos y enterobacterias, respectivamente. En ambos vegetales irradiados y no irradiados, no se detectó E. coli ni presencia de Salmonella spp. Durante el almacenamiento se observó un aumento de 1,6 - 1,7 logaritmos en ambos parámetros microbiológicos en las muestras no irradiadas. En los productos irradiados solo en apio se observó un aumento de 1,2 logaritmos en el recuento de aerobios mesófilos. En repollo el recuento de aerobios mesófilos se mantuvo sin variación en el tiempo, lo mismo se observó para el recuento de enterobacterias en ambos vegetales. No se detectaron diferencias significativas (p≥0,05) en la calidad sensorial total, entre el control no irradiado y los productos irradiados, ni entre los días de almacenamiento.

Autor: OROZCO,ANDRÉS FELIPE

Se presenta el caso de un soldado de veinte años de edad que desarrolló un absceso cerebral por Escherichia coli, secundario a un episodio de diarrea de siete días de evolución. Además de mostrar el curso clínico de la enfermedad y su tratamiento, se discuten las etiologías de los abscesos cerebrales, resaltando la importancia del seguimiento de las enfermedades diarreicas por simples que estas parezcan.

Autor: Ramos Martínez,A.

Los pacientes sometidos a sondaje vesical permanente presentan riesgo de padecer episodios de bacteriemias por Escherichia coli. Se presenta el caso de un varón de 88 años portador de sonda vesical permanente que ingresó por fractura cerrada subcapital del húmero izquierdo y hematuria debida a un carcinoma de vejiga. Durante el ingreso fue sometido a lavados vesicales y a una cistoscopia. Al octavo día de ingreso presentó un incremento de la tumefacción en el hombro izquierdo. Tanto la radiografía simple como la TAC demostraron aire en la proximidad de la fractura. Se intervino al paciente comprobando la existencia de un absceso maloliente sobre la fractura. Se aisló E. coli. La osteomielitis hematógena sobre un fractura cerrada es una complicación infrecuente que puede pasar desapercibida y se acompaña de un mal pronóstico. El uso racional y selectivo del sondaje vesical podría evitar algunos casos semejantes al presentado.

Autor: Morales,José-Luis

Objetivo: Estudiar la presencia de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) e identificar los tipos Temoniera (TEM) y sulfidrilo variable (SHV) producidas por cepas de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae en dos hospitales de Lima. Material y Métodos: La selección y confirmación de cepas productoras de BLEE se realizó mediante pruebas de susceptibilidad antimicrobiana, utilizando los criterios de la National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS); la identificación de los genes blaTEM y blaSHV se realizó mediante el análisis de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para su posterior secuenciamiento genético. Resultados: Se recolectó consecutivamente entre julio y septiembre de 2000, 137 cepas de Escherichia coli y 18 cepas de Klebsiella pneumoniae. La mayoría mostró alta resistencia a las cefalosporinas de tercera generación y aztreonam; 2,9% del total de E.coli y 44,4% del total de K.pneumoniae aisladas fueron confirmadas como productoras de BLEE. Todas las cepas productoras de BLEE fueron multirresistentes y la mayoría presentó co-resistencia a sulfametoxazol/trimetoprim, amikacina, gentamicina y ciprofoxacina. Se identificó la presencia del gen blaTEM en 4 cepas (3 K. pneumoniae y 1 E. coli) y el gen blaSHV en 6 cepas (3 K. pneumoniae y 3 E. coli). El secuenciamiento de los correspondientes genes confirmó las BLEEs TEM-10 y SHV-5. Conclusión: Se demostró la presencia de BLEE tipo TEM y SHV, asociado a multirresistencia antibiótica.

Autor: Tonkic,Marija

The prevalence of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae that produce extended-spectrum β-lactamases (ESBL) was investigated in patients of a university hospital in Split, Croatia. Patients were grouped according to age (pediatric vs. adult), antibiotic type, and hospital ward. From Jan. 2001 to Dec. 2002, the susceptibility of E. coli and K. pneumoniae isolates to antimicrobials was tested. ESBL production was assayed using the double-disk synergy test. ESBL-producing E. coli and K. pneumoniae were detected in all sites of infection sampled. The percentages of ESBL-positive isolates were higher in the pediatric wards than in the adult wards. The antibiotics most commonly prescribed to patients in all hospital wards belonged to the third-generation cephalosporin group. Among ESBL producers, E. coli isolates were more resistant to aminoglycosides, but less resistant to ciprofloxacin and cotrimoxazole. Resistance of E. coli and K. pneumoniae to ciprofloxacin was exclusively found in isolates from adult patients. None of the isolates, regardless of ESBL production, was resistant to carbapenemes. In addition, the prevalence and antimicrobial resistance of ESBL-producing E. coli and K. pneumoniae isolates differed between pediatric and adult patients.

Autor: Zambrano O,Pedro

Background: Hemolytic-uremic syndrome (HUS) is characterized by acute renal failure, microangiopathic hemolytic anemia and thrombocytopenia. Aim: To describe the characteñstics ofpatients with the diagnosis ofHUS in Chile, and to identify the most reliable early predictors oímorbidity and moñality. Material and methods: The clinical records ofpatients with HUS aged less than 15 years, attended between January 1990 and December 2003 in 15 hospitals, were reviewed. Demographic, clinical, biochemical, hematological parameters, morbidity and mortality were analyzed. Results: A cohort of 587 patients aged 2 to 8 years, 48% males, was analyzed. Ninety two percent had diarrhea. At the moment of diagnosis, anuria was observed in 39% of the patients, hypertension in 45% and seizures in 17%. Forty two percent required renal replacement therapy (RRT) and perítoneal dialysis was used in the majoríty of cases (78%). The most frequently isolated etiological agentwas Escherichia coli. Mortality rate was 2.9% in the acute phase of the disease and there was a positive correlation between mortality and anuria, seizures, white blood cell count (WCC) >20.000/mm³ and requirements of renal replacement therapy (p <0.05). Twelve percent of patients evolved to chronic renal failure and the risk factors during the acute phase were the need for renal replacement therapy, anuria, WCC >20.000/mm³, seizures and hypertension. Conclusions: The present study emphasizes important clinical and epidemiological aspeets ofHUSin a Chilean pediatricpopulation.